Klonlamanın ne amaçla ve nasıl yapıldığı bunu belirler. Sentetik biyoloji, canlı yapılara(hücre, sistem, organizma gibi) yeni bir özellik kazandırmayı amaçlıyor. Klonlama işlemi klonlanan canlıya yeni bir özellik kazandıracak çalışmaları kapsıyorsa evet. Ayrıca klonlamada kullanılan genom kısmen de olsa doğada bulunmayan, yani yapay amino asitlerden oluşturulmuşsa yine evet sentetik biyoloji içindedir denilebilir. Ama hiçbir yenilik kazandırmayı amaçlamayan sadece bir canlıyı daha önce yapıldığı şekliyle ve yöntemle (koyun Dolly gibi) klonlamak sentetik biyoloji değil.