Will CRISPR Transform Humanity? (ENGLISH/TURKISH)

Today, our mobile phones have a capacity of about 10 times higher than the NASA computer, which allowed Neil Armstrong to step up the moon in 1969. In those years, no one predicted that computers could come into this much of our daily lives. Now we can hardly take steps without our mobile phones, and we take this situation very naturally.

Genetic engineering is probably in the process of developing computers in the 60s and 70s, and technologies in this field have not yet been incorporated into our daily lives.

Our ancestors, made their first genetic practices by applying natural selection on animals and plants with the agricultural revolution. According to a theory, dogs evolved through the selection and feeding of calm and well-mannered wolves. It is not true to think that sheeps are so pliant animals since the time of their ancestors, especially those who are pliant have been chosen and maintained by our ancestors. The same is true for the watermelons, corns, strawberries that we eat today, the larger and more delicious ones have been selected for generations and they reached their present form.

Evolution is an excellent mechanism, but it has a problem: it works very slowly. Another problem faced by people dealing with genetics is that living organisms are extremely complex. No matter how complex a system is, it can be divided into subcomponents that are less complex. Decoding DNA was a big step forward in understanding how living things work. In 2001, the first DNA map of a human being cost $ 100 million. Nowadays, the gene mapping cost of an individual is around $ 1100.

)

Human gene mapping, has created a great hope for the fight against diseases. The results of studies in the field of genetics seem to be far from meeting these expectations. However, this situation may change recently.

The next step to identify the genes and figure out what each one doing is to change them. This process was first introduced in 2011 thanks to CRISPR technology, which can be executed in days rather than years. Experts say that genetic regulations are facilitated by 90% in this way. CRISPR (Cluster Regularly Interspersed Short Palindromic Repeat), is facilitating genome regulation in molecular biology/genetic engineering studies.

CRISPR is a DNA archive at its core. It has been developed by bacteria against viruses that are their main enemies. The viruses penetrate the outer surface of the bacteria and release their DNA. So they take over the bacteria cell and use it as a factory to produce viruses like themselves. This method does not always work, some bacteria are able to get rid of these virus attacks. The surviving bacteria take the copy of their DNA and put it in their archives. This archive is called CRISPR.

Once again, when the same virus attacks the bacterium, it pierces the outer surface of the bacterium and leaves its DNA inside. A protein called CAS9 compares every piece of the archive to the newly arrived DNA. When it detects the match, it cuts the DNA of the virus and the attack fails. You can follow the following video with real images of how the CAS9 protein works.

CRISPR is a method that can be used in any kind of living organizm. When this method was used in experiments, it was observed that the HIV virus disappeared in 50% of the mice. Although the success rate is still low in humans, it is hoped that progress will be achieved over time.

CRISPR is also intended to be used in the treatment of cancer. In China, studies have been initiated for the use of the method in the treatment of lung, stomach, lymph, breast and cervix cancers.

Humanity is fighting over 3000 hereditary diseases today. This technique promises hope for a definitive solution to hereditary diseases. The method was allowed to be used to prevent certain inherited diseases in the United States in February 2017. Again in 2017, the method was used in a human embryo for the first time to prevent an inherited heart disease.

Gene therapy on adult individuals is limited to that individual. However, interventions in the embryo stage have the potential to affect the human gene pool.

While certain diseases in humans are related to one gene, most diseases occur under the influence of more than one gene. The treatment of diseases caused by a single gene is relatively easy to identify and treat, but the treatment of diseases caused by the interaction of multiple genes is more difficult.

CRISPR can also be used to provide desirable features to subsequent generations beyond treatment. Eye color and gender, for example, can be modified with today's technology at embryo stage. While more than one gene is effective on features such as height and intelligence, it is not yet possible to make a modification in this direction effectively. The method can also be used for purposes such as slowing aging and improving the immune system.

Is it right to play with babies' genetics? Is it appropriate to intervene in the human genome, which has been optimized for 3,8 billion years, using a method that has not yet reached 10 years of history? What if we encounter unexpected consequences?

I recently watched a documentary on the subject at Netflix. It was mentioned that the dwarfism would be history by the CRISPR method. While the dwarf parents were happy that their children would not be like themselves, they were concerned about the disappearance of dwarves from the world.

The nature of babies to be born, or the possibility of emergence of some diseases was largely due to the factor of chance, while the poor were at least subject to the same conditions as the rich. New technologies raise concerns about the gap between the rich and the poor. Will the enormous diversity seen in humans disappear? What if this technology comes into malicious hands and used to create a superior race or to design super soldiers?

There are a lot of concerns about the subject. Nevertheless, the advantages of the method seem to be pressing heavily.

CAS9 is such a useful protein that it allows us to upload videos to the DNA. As shown in the image below, the loaded image can be red over DNA with accuracy of over 90%.

We're entering a strange period where we begin to shape our own biology, Hopefully everything will go well.

Thanks for reading.

Image Sources: https://pixabay.com and https://giphy.com/

CRISPR İnsanlığı Dönüştürecek Mi?

Bugün cep telefonlarımız 1969 yılında aya ayak basılmasını sağlayan NASA bilgisayarından yaklaşık 10 kat daha yüksek kapasiteye sahip. O yıllarda bilgisayarların gelecekte günlük hayatımızın bu denli içine girebileceğini hiç kimse tahmin etmiyordu. Şimdilerde bilgisayarlar olmadan neredeyse adım atamaz hale geldik ve bu durumu çok doğal karşılıyoruz.

Genetik mühendisliği galiba bilgisayarların 60'lı ve 70'li yıllarda içinde bulunduğu gelişmişlik aşamasında bulunuyor, henüz bu alandaki teknolojiler günlük hayatlarımıza dahil olmuş değil.

Tarım devrimiyle birlikte yerleşik hayata geçen atalarımız hayvanlar ve bitkiler üzerinde doğal seçilim uygulayarak ilk genetik uygulamalarını yapmış oldular. Bir teoriye göre köpekler sakin ve iyi huylu kurtların seçilip beslenmesi yoluyla evrimleşmiş. Koyunların ezelden beri bu denli uysal hayvanlar olduğunu düşünmemek gerekiyor, uysal olanlar özellikle seçilip soyların sürdürmeleri sağlanmış. Bugün yediğimiz karpuzlar, mısırlar, çilekler için de aynı durum geçerli, nesiller boyunca daha iri ve lezzetli olanları seçilerek bugünkü formlarına ulaşmışlar.

Evrim mükemmel bir mekanizma ancak bir sorunu var: Çok yavaş işliyor. Genetik işi ile uğraşan insanların karşılaştığı bir diğer sorun canlı organizmaların olağanüstü derece karmaşık olmaları. Bir sistem ne kadar karmaşık olursa olsun, daha az karmaşık olan alt bileşenlere ayrılabilir. DNA kodunun çözülmesi canlıların nasıl işlediğini anlamak yolunda büyük bir adım oldu. 2001 yılında bir insana ait ilk DNA haritasının çıkarılması 100 milyon dolara mal oldu. Bugünlerde 1100 USD civarı bir maliyetle gen haritası çıkarılabilir duruma geldi.

İnsanın gen haritasının çıkarılması zamanında hastalıklarla mücadele konusunda büyük bir umut yaratmıştı. Genetik alanında yapılan çalışmalardan elde edilen sonuçlar henüz bu beklentileri karşılamaktan uzak görünüyor. Ancak bu durum yakın zamanda değişebilir.

Genleri tanımlamak ve her birinin ne işe yaradığını anlamaktan sonraki adım onları değiştirmek oluyor. Bu işlem ilk kez 2011 yılında gündeme gelen CRISPR teknolojisi sayesinde yıllar yerine günler içinde yapılır hale geldi. Konunun uzmanları genetik düzenlemelerin bu yolla %90 oranında kolaylaştığını ifade ediyorlar. Moleküler biyoloji/genetik mühendisliği çalışmalarında genom düzenlenmesini kolaylaştıran CRISPR Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats sözcüklerinin ilk harflerini ifade ediyor. (Türkçesi: Düzenli Aralıklarla Bölünmüş Kısa Palindromik Tekrar Kümeleri)

CRISPR özünde bir DNA arşividir. Bakteriler tarafından baş düşmanları olan virüslere karşı geliştirilmiştir. Virüsler bakterilerin dış cephesini delerek içeriye kendi DNA'sını bırakıyorlar. Bu sayede bakteri hücresini ele geçirip onu kendisi gibi virüsleri üretmek için bir fabrika niyetine kullanıyorlar. Bu yöntem her zaman işe yaramıyor, bazı bakteriler bu virüs saldırılarından kurtulmayı başarabiliyorlar. Kurtulan bakteriler DNA'sını alarak arşivine koyuyor. Bu arşiv CRISPR olarak isimlendiriliyor.

Aynı virüs bakteriye bir kez daha saldırdığında yine bakterinin dış cephesini deliyor ve içeriye DNA'sını bırakıyor. CAS9 adındaki bir protein arşivdeki her parçayı yeni gelen DNA ile karşılaştırıyor. Eşleşmeyi tespit ettiği anda virüsün DNA'sını kesiyor ve saldırıyı başarısız kılıyor.

CRISPR her türlü canlıda kullanılabilen bir yöntem. Yapılan deneylerde bu yöntem kullanıldığında denek farelerin %50'sinde HIV virüsünin ortadan kalktığı görüldü. İnsanlarda başarı oranı henüz düşük seviyede olsa da zamanla gelişme kaydedilmesi umuluyor.

CRIPR tekniğinin kanser tedavisinde kullanılması da amaçlanıyor. Çin'de yöntemin akçiğer, mide, lenf, meme ve rahim ağzı kanserlerinin tedavisinde yöntemin kullanılması için çalışmalar başlatılmış durumda.

İnsanlık bugün 3000'in üzerinde kalıtımsal hastalıkla mücadele ediyor. Bu teknik kalıtımsal hastalıklara kesin bir çözüm bulunması yönünde umut vaat ediyor. Şubat 2017'de ABD'de yöntemin bazı kalıtsal hastalıkların önlemesinde kullanılması izin verildi. Yine 2017'de yöntem kalıtsal bir kalp hastalığını önlemek üzere ilk kez bir insan embriyosunda kullanıldı.

Yetişkin bireyler üzerinde yapılan gen terapileri o bireyle sınırlı kalıyor. Oysa embriyo aşamasında yapılan müdahaleler insanlığın gen havuzunu etkileme potansiyeli barındırıyor.

İnsandaki belirli hastalıklar tek genle ilgiliyken, çoğu hastalık birden fazla genin etkisiyle oluşuyor. Tek bir genin neden olduğu hastalıkların tanımlanması ve tedavisi görece kolayken birden fazla genin etkileşimiyle oluşan hastalıkların tedavisi daha zor.

CRISPR tedavinin ötesinde sonraki nesillere arzu edilen özellikler kazandırmak için de kullanılabilir. Göz rengi ve cinsiyet örneğin embriyo aşamasında bugünün teknolojisiyle modifiye edilebiliyor. Boy ve zeka gibi diğer özellikler üzerinde ise birden fazla gen etkili olduğundan bu yönde bir modifikasyon yapmak henüz mümkün değil. Yöntemin yaşlanmayı yavaşlatmak, bağışıklık sistemini geliştirmek gibi amaçlarla da kullanılabileceği düşünülüyor.

Bebeklerin genetiği ile oynamak doğru bir davranış mı? Geçmişi henüz 10 yılı bile bulmayan bir yöntemi kullanarak 3,8 milyar yılda optimize olmuş insan genomuna müdahale etmek ne kadar doğru? Ya beklenmedik kötü sonuçlarla karşılaşırsak?

Geçenlerde Netflix'de konuyla ilgili bir belgesel seyrettim. Cüceliğin CRISPR yöntemi sayesinde tarih olacağından söz ediliyordu. Cüce anne babalar bir yandan çocuklarının kendileri gibi olmayacağına sevinirken bir yandan da cüceliğin dünyadan silinmesinden endişe ediyorlardı.

Doğacak bebeklerinin niteliği ya da bazı hastalıkların ortaya çıkma olasılığı büyük ölçüde şans faktörüne bağlıyken yoksullar en azından bu konuda zenginlerle aynı koşullara tabiydi. Bu gibi teknolojiler zenginlerle fakirler arasındaki uçurumun açılması endişesini doğruyor. Mükemmel olmayan insanlar ne olacak? İnsanlarında görülen muazzam çeşitlilik bu yüzden yok mu olacak? Bu teknoloji kötü niyetli ellere geçerse ve üstün bir ırk yaratmak ya da süper askerler tasarlamak üzere kullanırlarsa? İster istemez insanın aklına GATTACA filmi geliyor.

Konu hakkındaki sorular ve kaygılar oldukça fazla. Yine de yöntemin sağladığı avantajlar ağır basıyor gibi görünüyor.

CAS9 öylesine kullanışlı bir protein ki onun sayesinde DNA'ya video yüklenmesi sağlandı. Aşağıdaki görüntüde görüldüğü üzere görüntü %90'ın üzerinde bir doğrulukla DNA üzerinden okunabiliyor.

Kendi biyolojimizi şekillendirmeye başlayacağımız tuhaf bir döneme giriyoruz, umarım her şey yolunda gider.

Okuduğunuz için teşekkür ederim.